Гени метилювання ДНК
Від Li Dali, Ph.D.
Якщо ви пройшли тест ДНК такий як 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage або іншій компанії, що займається тестуванням, ви можете дізнатися більше про особисті фактори ризику основних захворювань. Натиснувши кнопку вище ⬆️, ви можете завантажити файл даних ДНК і отримати найповніший персоналізований 250-сторінковий звіт про стан здоров'я з посиланнями на дослідження.
Перевірка генетичного метилювання вивчає вашу ДНК, щоб запропонувати розуміння ваших унікальних шляхів метилювання. Метилювання — це важливий процес, який забезпечує оптимальне функціонування ваших генів. Таким чином, отримання розуміння ваших індивідуальних шляхів метилювання має важливе значення для оптимізації вашого здоров’я. Людина володіє приблизно 20 000 генами, серед яких MTHFR відповідає за допомогу організму в переробці фолієвої кислоти. На жаль, 30-60 відсотків людей є носіями варіанту гена MTHFR, що потенційно може призвести до зниження рівня фолієвої кислоти та вітамінів групи В, а також до підвищення рівня гомоцистеїну в крові. Як наслідок, мутації в гені MTHFR можуть схиляти людей до підвищеного ризику різноманітних поширених проблем зі здоров’ям з часом, включаючи хвороби серця, які можна запобігти, рак товстої кишки, інсульт, хворобу Альцгеймера тощо. Було ідентифіковано дві основні генетичні варіації гена MTHFR, обидві пов’язані зі змінами функції ферменту MTHFR і метаболізму фолієвої кислоти. Першою є мутація C677T, де цитозин (C) замінюється нуклеотидом тиміну (T) у позиції 677 гена MTFHR, що призводить до зміни амінокислоти (аланін замінено валіном) у структурі білка MTHFR. Ця варіація відносно поширена; у Сполучених Штатах 25% латиноамериканців і 10-15% кавказців носять дві копії C677T. Особи з гомозиготними мутаціями (C677TT) виявляють 30% зниження функції ферменту MTHFR, тоді як особи з гетерозиготними мутаціями (C677CT) демонструють 65% активність ферменту.
Другим поширеним поліморфізмом MTHFR є A1298C, де аденін (A) замінюється нуклеотидом цитозину (C) у положенні 1298 гена MTHFR, що призводить до зміни амінокислоти (глутамат замінюється аланіном) у структурі MTHFR. Поліморфізм MTHFR 1298C присутній приблизно у 25% населення світу. У гетерозиготних (A1298AC) і гомозиготних (A1298CC) носіїв активність MTHFR знижується на 15% і 30% відповідно. Генетичне тестування необхідно для оцінки гена MTHFR на мутації. Це можна зробити за допомогою аналізу крові або слини. Тест зазвичай оцінює два різні гени, C677T і A1298C, кожен з яких має дві копії. Мутація, що включає обидві копії гена, називається гомозиготною мутацією, тоді як залучення лише однієї копії називається гетерозиготною мутацією. Підвищений рівень гомоцистеїну в крові може вказувати на SNP в гені MTHFR, але пряме тестування на SNP є золотим стандартом.
Важливо визнати, що ця мутація є спадковою і може передаватися через членів сім’ї. Однак ми можемо пом’якшити вплив цих генетичних мутацій, підтримуючи процес метилювання за допомогою дієтичних заходів і добавок. Важливо пам’ятати, що наша генетична структура не лише визначає результати нашого здоров’я — дієта та поживні речовини відіграють значну роль у впливі на експресію генів.
Пройдіть за посиланням обраного поліморфізму, щоб прочитати короткий опис як обраний поліморфізм впливає на Метилювання та гомоцистеїн і ознайомтеся зі списком існуючих досліджень.
Поліморфізми SNP, пов'язані з темою Метилювання та гомоцистеїн:
| rs4680 | Дослідження показало збільшення загального гомоцистеїну в плазмі (tHcy) на 10% |
| rs819171 | Ризикова алель знижує активність гена AHCY, що може зменшувати утворення S-аденозилметіоніну (SAM-e), і, в свою чергу, збільшувати накопичення гомоцистеїну та аміаку в організмі. Дефіцит SAM-e пов'язаний з різними розладами здоров'я, включаючи депресію, перепади настрою, артрит та фіброміалгію. |
| rs1051266 | Білок, що кодується геном, транспортує фолієву кислоту в клітину і, таким чином, відіграє роль у внутрішньоклітинному регулюванні концентрації фолату. При цьому генотипі гірше засвоювання фолатів. Вище потреба у фолієвій кислоті. Вживання алкоголю критичніше щодо ризику дефіциту за вітаміном В9. |
| rs17367504 | Поліморфізм пов'язаний зі збільшенням гомоцистеїну в плазмі та підвищеним ризиком гіпертонічної хвороби. |
| rs2274976 | Поліморфізм пов'язаний із збільшенням гомоцистеїну в плазмі, залежний від вітаміну B12 та фолату B9. |
| rs3741049 | Дефект гена викликає дефіцит 3-кетотиолази, що викликає зростання кишкових мікробів (особливо клостридій) і негативно впливає на метилювання. |
| rs651852 | Виявлений генотип містить ризиковий алель, що потенційно знижує ефективність процесу метилювання та може погіршувати стан здоров'я. Активність цього гена може зменшуватись під впливом психологічного стресу, що підвищує рівень кортизолу |
| rs567754 | Виявлений генотип C/T містить ризиковий алель |
| rs1801131 | Знижує утворення активної форми фолієвої кислоти, необхідної для реметилювання гомоцистеїну та інших молекул ДНК. Призначення активної форми фолієвої кислоти (5-MTHF або L-метилтетрагідрофолату) може значно покращити показники ризику наслідків мутацій. Також фактор, що помірно підвищує потребу у вітаміні В2. |
| rs2236225 | Можливий підвищений ризик уроджених дефектів плода. У 1.5 рази вищий ризик для матерів європеоїдної раси народити дітей із ДНТ (дефектом нервової трубки). Зв'язок у дітей з даною мутацією з підвищеним ризиком вад серця, більшою мірою, якщо їх мати не отримувала достатньої кількості фолієвої кислоти під час вагітності. Ризик знижується при достатньому рівні фолієвої кислоти в організмі та вітаміну В6. |
| rs1979277 | Поліморфізм ферментів, що метаболізують фолієву кислоту. Потрібно отримання достатньої кількості вітаміну В6 для оптимальної активності гена. |
| rs2287780 | Поліморфізм в генах шляху фолієвої кислоти, що викликає дефіцит B12 та збільшення гомоцистеїну. |
| rs1801394 | Поліморфізм може призводити до підвищення рівня гомоцистеїну незалежно від рівнів вмісту фолієвої кислоти, вітамінів B12 або B6. Є фактором ризику дефектів нервової трубки та синдрому Дауна в умовах вищого рівня гомоцистеїну. |
| rs9606756 | Поліморфізм пов'язаний з рівнями вітаміну B12 у сироватці крові. Також пов'язаний із концентрацією транскобаламіну у вагітних жінок та ризиком дефектів нервової трубки у плода. |
| rs1805087 | Помірний фактор ризику гіпергомоцистеїнемії. Фактор, що підвищує потребу організму у фолієвій кислоті та вітаміні В12. |
| rs651933 | Може означати, що фолієва кислота не може транспортуватися в клітини, і може вказувати на потребу більшої кількості фолієвої кислоти. |
| rs7946 | Генетичні поліморфізми в метаболізмі метильних груп. Метилювання ДНК у периферичній крові. Впливають на потребу людини у холіні (вітамін B4). |
| rs11754661 | Генетична зміна шляху фолатів, що впливає на вміст метилювання геному. |
| rs17349743 | Ген відповідає за аномалії фолатного шляху, збільшує ймовірність появи хвороби Альцгеймера в пізньому віці. |
| rs1800779 | Поліморфізм гена пов'язаний з маркерами ризику серцево-судинних захворювань, порушенням процесу метилювання. |
| rs162036 | Порушення внутрішньоклітинного метаболізму кобаламіну. Позитивно впливає на ефективність терапії фолієвою кислотою у пацієнтів із гіпергомоцистеїнемією. |
| rs1799983 | Зменшує активність гена NOS3 і може знижувати ефективність процесу метилювання. Також пов'язаний із підвищенням маркерів ризику серцево-судинних проблем, таких як рівень загального холестерину та ліпопротеїнів низької щільності (ЛПНЩ), а також з підвищеним ризиком високого кров'яного тиску, особливо у вагітних. |
| rs1131603 | Зміна концентрації транскобаламіну2, пов'язана з постінсультним гомоцистеїном, змінює ризик повторного інсульту. |
| rs4820889 | Зміна концентрації транскобаламіну2, пов'язана з постінсультним гомоцистеїном, змінює ризик повторного інсульту. |
| rs526934 | Викликає зменшення концентрації вітаміну B6, вітаміну B12, фолієвої кислоти та збільшення гомоцистеїну в крові. |
| rs1999594 | Викликає зменшення концентрації вітаміну B6, вітаміну B12, фолієвої кислоти та збільшення гомоцистеїну в крові. |
| rs4633 | Дефіцит катехол-О-метилтрансферази пов'язаний з рівнем загального гомоцистеїну в плазмі та може підвищувати ризик венозного тромбозу. |
| rs10380 | Поломка викликає дефіцит вітаміну В12 - метилкобаламіну cblE та порушення метилювання. Необхідний додатковий прийом підвищених доз вітаміну В12 активної форми. Також поліморфізм пов'язаний із ризиком розвитку раку підшлункової залози. |
| rs4654748 | Поломка викликає дефіцит активної форми вітаміну В6 - піридоксаль-5'-фосфату (p-5-p). Рекомендується додатковий прийом p-5-p. |
| rs3733890 | Поліморфізм гена BHMT призводить до підвищеної активності гена BHMT (відомо так само як «посилення регуляції»). Підвищена регуляція BHMT може призвести до зниження рівня гомоцистеїну, а також до меншої залежності від фолієвої кислоти та вітаміну B-12 як донорів метилу. |
| rs1801133 | Фрагмент гена, відомий як MTHFR C677T, який кодує фермент, що бере участь у метаболізмі фолієвої кислоти. Поломка цього фрагмента генів призводить до високого рівня гомоцистеїну, низького рівня B12 та фолієвої кислоти. Якщо ваші тести показують високий рівень гомоцистеїну, ваш лікар швидше за все порадить вам відповідну дієту та режим прийому добавок. Для зниження ризиків рекомендується прийом різновидів активної форми метилфолату В9 (5-MTHF або L-метилтетрагідрофолату), активної форми вітаміну В12 - метилкобаламін. |
| rs234706 | Поліморфізм цистатіонінбету-синтази, що збільшує ризик гіпергомоцистеїнемії. |
| rs4244593 | |
| rs1476413 | |
| rs502396 | |
| rs6495446 | |
| rs1076991 | |
| rs2283873 | |
| rs1802059 | |
Про Автора
Li Dali
Лі Далі, отримувач гранту Національного фонду видатних молодих кадрів, є дослідником у Школі природничих наук Східнокитайського нормального університету. Він здобув ступінь доктора наук з генетики у Хунанському нормальному університеті у 2007 році і здійснював спільні дослідження в Техаському університеті A&M під час навчання в докторантурі. Лі Далі та його команда оптимізували та інновували технологію генного редагування, що привело до створення світового класу для конструювання моделей хвороб за допомогою генного редагування. Біологічно активна форма вітаміну К діє як допоміжний фактор у реакції, вирішальній як для... Вітамін В2, також відомий як рибофлавін, є життєво важливою поживною речовиною, необхідною для... Холін (вітаман В4) є життєво важливою поживною речовиною, якої часто не вистачає в багатьох дієтах....
