Генетичний ВІЛ

Від Li Dali, Ph.D.

Якщо ви пройшли тест ДНК такий як 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage або іншій компанії, що займається тестуванням, ви можете дізнатися більше про особисті фактори ризику основних захворювань. Натиснувши кнопку вище ⬆️, ви можете завантажити файл даних ДНК і отримати найповніший персоналізований 250-сторінковий звіт про стан здоров'я з посиланнями на дослідження.

ВІЛ, вірус, який викликає імунодефіцит у людей, належить до роду Lentivirus у підродині Orthoretrovirinae родини Retroviridae [1]. ВІЛ класифікується на два типи, ВІЛ-1 і ВІЛ-2, на основі генетичних ознак і варіацій вірусних антигенів. Рід Lentivirus також включає віруси імунодефіциту приматів, відмінні від людини, такі як вірус імунодефіциту мавп (SIV).

Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr і Vpu (або Vpx для ВІЛ-2) — це гени, які регулюють білки, відповідальні за контроль здатності ВІЛ інфікувати клітини, розмножуватися та викликати захворювання.

Варіації в генах, які впливають на сприйнятливість до ВІЛ-інфекції:

Проникнення ВІЛ-1 у клітини сприяє CCR5, первинний корецептор. Варіації в кодуючому гені та промоторі CCR5 можуть змінювати експресію рецептора на поверхні клітини, впливаючи на прогресування інфекції. CCR5, також відомий як CD195, є β-хемокіновим рецептором, розташований на хромосомі 3, р-гілка в позиції 21. Ген має численні алельні варіації, включаючи мутацію delta32 (rs333), яка призводить до нефункціонального рецептора через 32 bp делеція. ВІЛ-1 вимагає зв’язування з рецепторами CCR5 і CXCR4 на лімфоцитах CD4 через вірусний глікопротеїн gp120, щоб проникнути в клітини. Однак мутація delta32 перешкоджає проникненню ВІЛ-1 в Т-клітини, роблячи людей, гомозиготних за мутацією (delta32-delta32), стійкими до інфекції ВІЛ-1. CCR5-delta32 присутній у 5-14% європейських популяцій, але рідко зустрічається в азіатських і африканських популяціях.

CD192, також відомий як CCR2, є хемокіновим рецептором, який виробляється геном CCR2. Цей ген кодує дві ізоформи моноцитарного хемоаттрактанта-1 рецептора CCL2, який відповідає за хемотаксис моноцитів. CD192 відіграє вирішальну роль у міграції моноцитів під час запальних захворювань, таких як ревматоїдний артрит, а також відповідає за запальну відповідь на пухлини. Крім того, рецептори, що виробляються цим геном, полегшують залежну від агоніста мобілізацію кальцію та інгібують аденілатциклазу.

Ген CX3CR1 виробляє білок з такою ж назвою, який також називають рецептором фракталкіну або рецептором G-білка 13 (GPR13). Цей білок зв’язується з хемокіном CX3CL1, який включає фракталкін і нейротактин, і впливає на адгезію та міграцію лейкоцитів. Крім того, CX3CR1 діє як корецептор для ВІЛ-1 і полегшує проникнення вірусу в клітини. Зміни в цьому гені можуть збільшити сприйнятливість до інфекції ВІЛ-1 і прискорити прогресування СНІДу.

Ген HLA-C має 5'-область під назвою Rs9264942, розташовану на відстані 35 кб від початку транскрипції. Цей регіон має різні генетичні варіанти (T/T, C/T і C/C). Серед громадян Європи приблизно 10% мають варіант C/C, що пов’язано зі значним зниженням вірусного навантаження ВІЛ порівняно з гомозиготами T/T. Антигени HLA-C мають вирішальне значення для контролю ВІЛ-інфекції, слугуючи лігандами для KIR на NK-клітинах і презентуючи антигени цитотоксичним Т-лімфоцитам. На рівень активації NK-лімфоцитів впливає експресія HLA-C.

HLA-B*57 — це тип антигену B17, який зазвичай використовується для лікування ВІЛ-інфікованих пацієнтів. Його призначення є особливо важливим для визначення ймовірності реакції гіперчутливості на абакавір. До рутинного використання тесту на HLA-B*5701 у пацієнтів з ВІЛ близько 8% тих, хто приймав абакавір, відчували реакції гіперчутливості, які потенційно могли призвести до небезпечних для життя анафілактичних реакцій після повторного прийому препарату. Проте ідентифікація HLA-B*57 допомогла значно знизити цей ризик із позитивним прогнозним значенням 61,2%, негативним прогнозним значенням 95,5%, чутливістю 44% і специфічністю 96%.

Пройдіть за посиланням обраного поліморфізму, щоб прочитати короткий опис як обраний поліморфізм впливає на ВІЛ і ознайомтеся зі списком існуючих досліджень.

Поліморфізми SNP, пов'язані з темою ВІЛ:

Про Автора

Лі Далі, отримувач гранту Національного фонду видатних молодих кадрів, є дослідником у Школі природничих наук Східнокитайського нормального університету. Він здобув ступінь доктора наук з генетики у Хунанському нормальному університеті у 2007 році і здійснював спільні дослідження в Техаському університеті A&M під час навчання в докторантурі. Лі Далі та його команда оптимізували та інновували технологію генного редагування, що привело до створення світового класу для конструювання моделей хвороб за допомогою генного редагування.

Гени інсульту

Ішемічний інсульт має багатофакторну етіологію, де значну роль відіграють генетичні причини,...

СДУГ - це генетично

СДУГ, поведінковий розлад, який зазвичай починається в дитинстві, характеризується короткочасною...

Гени епілепсії

Якщо судоми викликані відомим або передбачуваним генетичним дефектом або проблемою, пов’язаною з...

Список усіх хвороб