Якщо ви пройшли тест ДНК такий як 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage або іншій компанії, що займається тестуванням, ви можете дізнатися більше про особисті фактори ризику основних захворювань. Натиснувши кнопку вище ⬆️, ви можете завантажити файл даних ДНК і отримати найповніший персоналізований 250-сторінковий звіт про стан здоров'я з посиланнями на дослідження.
ВІЛ, вірус, який викликає імунодефіцит у людей, належить до роду Lentivirus у підродині Orthoretrovirinae родини Retroviridae [1]. ВІЛ класифікується на два типи, ВІЛ-1 і ВІЛ-2, на основі генетичних ознак і варіацій вірусних антигенів. Рід Lentivirus також включає віруси імунодефіциту приматів, відмінні від людини, такі як вірус імунодефіциту мавп (SIV).
Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr і Vpu (або Vpx для ВІЛ-2) — це гени, які регулюють білки, відповідальні за контроль здатності ВІЛ інфікувати клітини, розмножуватися та викликати захворювання.
Варіації в генах, які впливають на сприйнятливість до ВІЛ-інфекції:
Проникнення ВІЛ-1 у клітини сприяє CCR5, первинний корецептор. Варіації в кодуючому гені та промоторі CCR5 можуть змінювати експресію рецептора на поверхні клітини, впливаючи на прогресування інфекції. CCR5, також відомий як CD195, є β-хемокіновим рецептором, розташований на хромосомі 3, р-гілка в позиції 21. Ген має численні алельні варіації, включаючи мутацію delta32 (rs333), яка призводить до нефункціонального рецептора через 32 bp делеція. ВІЛ-1 вимагає зв’язування з рецепторами CCR5 і CXCR4 на лімфоцитах CD4 через вірусний глікопротеїн gp120, щоб проникнути в клітини. Однак мутація delta32 перешкоджає проникненню ВІЛ-1 в Т-клітини, роблячи людей, гомозиготних за мутацією (delta32-delta32), стійкими до інфекції ВІЛ-1. CCR5-delta32 присутній у 5-14% європейських популяцій, але рідко зустрічається в азіатських і африканських популяціях.
CD192, також відомий як CCR2, є хемокіновим рецептором, який виробляється геном CCR2. Цей ген кодує дві ізоформи моноцитарного хемоаттрактанта-1 рецептора CCL2, який відповідає за хемотаксис моноцитів. CD192 відіграє вирішальну роль у міграції моноцитів під час запальних захворювань, таких як ревматоїдний артрит, а також відповідає за запальну відповідь на пухлини. Крім того, рецептори, що виробляються цим геном, полегшують залежну від агоніста мобілізацію кальцію та інгібують аденілатциклазу.
Ген CX3CR1 виробляє білок з такою ж назвою, який також називають рецептором фракталкіну або рецептором G-білка 13 (GPR13). Цей білок зв’язується з хемокіном CX3CL1, який включає фракталкін і нейротактин, і впливає на адгезію та міграцію лейкоцитів. Крім того, CX3CR1 діє як корецептор для ВІЛ-1 і полегшує проникнення вірусу в клітини. Зміни в цьому гені можуть збільшити сприйнятливість до інфекції ВІЛ-1 і прискорити прогресування СНІДу.
Ген HLA-C має 5'-область під назвою Rs9264942, розташовану на відстані 35 кб від початку транскрипції. Цей регіон має різні генетичні варіанти (T/T, C/T і C/C). Серед громадян Європи приблизно 10% мають варіант C/C, що пов’язано зі значним зниженням вірусного навантаження ВІЛ порівняно з гомозиготами T/T. Антигени HLA-C мають вирішальне значення для контролю ВІЛ-інфекції, слугуючи лігандами для KIR на NK-клітинах і презентуючи антигени цитотоксичним Т-лімфоцитам. На рівень активації NK-лімфоцитів впливає експресія HLA-C.
HLA-B*57 — це тип антигену B17, який зазвичай використовується для лікування ВІЛ-інфікованих пацієнтів. Його призначення є особливо важливим для визначення ймовірності реакції гіперчутливості на абакавір. До рутинного використання тесту на HLA-B*5701 у пацієнтів з ВІЛ близько 8% тих, хто приймав абакавір, відчували реакції гіперчутливості, які потенційно могли призвести до небезпечних для життя анафілактичних реакцій після повторного прийому препарату. Проте ідентифікація HLA-B*57 допомогла значно знизити цей ризик із позитивним прогнозним значенням 61,2%, негативним прогнозним значенням 95,5%, чутливістю 44% і специфічністю 96%.
Пройдіть за посиланням обраного поліморфізму, щоб прочитати короткий опис як обраний поліморфізм впливає на ВІЛ і ознайомтеся зі списком існуючих досліджень.
Поліморфізми SNP, пов'язані з темою ВІЛ:
rs8321 | Однонуклеотидний поліморфізм HLA-C пов'язаний з підвищеним рівнем вірусного навантаження у осіб, інфікованих ВІЛ-1. |
rs152363 | |
rs444772 | |
rs477687 | |
rs667859 | |
rs1015164 | |
rs1020064 | |
rs1127888 | |
rs1265112 | |
rs1360517 | |
rs1522232 | |
rs1556032 | |
rs1799864 | На 58% більше ризик розвитку СНІДу протягом перших 4 років після позитивного результату тесту на ВІЛ. |
rs2234358 | Ген CXCR6 як новий хемокіновий рецептор, що бере участь у довгостроковому запобіганні прогресу СНІДу. |
rs2306242 | |
rs2395029 | Однонуклеотидний поліморфізм HCP5 пов'язаний з повільним прогресуванням СНІДу у жінок, інфікованих ВІЛ-1. |
rs2572886 | У 1.4 рази підвищений ризик зараження ВІЛ. |
rs3108919 | |
rs3131018 | |
rs3796375 | |
rs4118325 | |
rs4418214 | |
rs6076463 | |
rs6441975 | |
rs6467710 | |
rs7217319 | |
rs8069770 | |
rs9261174 | |
rs9264942 | |
rs9368699 | Однонуклеотидний поліморфізм, який сприяє природному довготривалому уповільненню прогресування ВІЛ-інфекції. |
rs10484554 | |
rs10800098 | |
rs11239930 | |
rs11884476 | |
rs12483205 | |
rs17762192 | Локус 1q41, пов'язаний зі швидкістю прогресування захворювання на ВІЛ-1 до клінічного СНІДу. |
rs572880838 | |