VIH génétique

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Le VIH, un virus responsable de l'immunodéficience chez l'homme, appartient au genre Lentivirus de la sous-famille Orthoretrovirinae de la famille des Retroviridae [1]. Le VIH est classé en deux types, VIH-1 et VIH-2, en fonction des traits génétiques et des variations des antigènes viraux. Le genre Lentivirus comprend également les virus de l’immunodéficience des primates non humains, tels que le virus de l’immunodéficience simienne (SIV).

Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr et Vpu (ou Vpx pour VIH-2) sont des gènes qui régulent les protéines responsables du contrôle de la capacité du VIH à infecter les cellules, à se répliquer et à provoquer des maladies.

Variations dans les gènes qui ont un impact sur la susceptibilité à l'infection par le VIH :

L’entrée du VIH-1 dans les cellules est facilitée par CCR5, un corécepteur principal. Les variations du gène codant et du promoteur de CCR5 peuvent modifier l’expression du récepteur à la surface cellulaire, impactant ainsi la progression de l’infection. CCR5, également connu sous le nom de CD195, est un récepteur de β-chimiokine situé sur le chromosome 3, branche p en position 21. Le gène présente de multiples variations alléliques, notamment la mutation delta32 (rs333), qui entraîne un récepteur non fonctionnel en raison d'un Suppression de 32 pb. Le VIH-1 nécessite une liaison aux récepteurs CCR5 et CXCR4 des lymphocytes CD4 via la glycoprotéine virale gp120 pour pénétrer dans les cellules. Cependant, la mutation delta32 empêche le VIH-1 de pénétrer dans les cellules T, rendant les individus homozygotes pour la mutation (delta32-delta32) résistants à l'infection par le VIH-1. CCR5-delta32 est présent dans 5 à 14 % des populations européennes, mais est rare dans les populations asiatiques et africaines.

CD192, également connu sous le nom de CCR2, est un récepteur de chimiokine produit par le gène CCR2. Ce gène code pour deux isoformes du récepteur chimioattractant-1 CCL2 des monocytes, responsable de la chimiotaxie des monocytes. Le CD192 joue un rôle crucial dans la migration des monocytes lors de maladies inflammatoires comme la polyarthrite rhumatoïde et est également responsable de la réponse inflammatoire aux tumeurs. De plus, les récepteurs produits par ce gène facilitent la mobilisation du calcium dépendante de l'agoniste et inhibent l'adénylate cyclase.

Le gène CX3CR1 produit une protéine du même nom, également appelée récepteur de fractalkine ou récepteur 13 de la protéine G (GPR13). Cette protéine se lie à la chimiokine CX3CL1, qui comprend la fractalkine et la neurotactine, et affecte l'adhésion et la migration des leucocytes. De plus, CX3CR1 agit comme co-récepteur du VIH-1 et facilite l'entrée du virus dans les cellules. Les altérations de ce gène peuvent augmenter la susceptibilité à l'infection par le VIH-1 et accélérer la progression vers le SIDA.

Le gène HLA-C possède une région 5' appelée Rs9264942, située à 35 Ko du début de la transcription. Cette région présente différentes variantes génétiques (T/T, C/T et C/C). Parmi les citoyens européens, environ 10 % sont porteurs du variant C/C, qui est lié à une diminution significative de la charge virale du VIH par rapport aux homozygotes T/T. Les antigènes HLA-C jouent un rôle crucial dans le contrôle de l'infection par le VIH en servant de ligands pour le KIR sur les cellules NK et en présentant des antigènes aux lymphocytes T cytotoxiques. Le niveau d’activation des lymphocytes NK est influencé par l’expression de HLA-C.

HLA-B*57 est un type d’antigène B17 couramment utilisé dans les soins aux patients séropositifs. Sa désignation est particulièrement importante pour déterminer la probabilité d'une réaction d'hypersensibilité à l'abacavir. Avant l'utilisation systématique du test HLA-B*5701 chez les patients VIH, environ 8 % des personnes prenant de l'abacavir présentaient des réactions d'hypersensibilité, qui pourraient potentiellement conduire à des réactions anaphylactiques potentiellement mortelles lors de la réadministration du médicament. Cependant, l'identification du HLA-B*57 a permis de réduire significativement ce risque, avec une valeur de prédiction positive de 61,2 %, une valeur de prédiction négative de 95,5 %, une sensibilité de 44 % et une spécificité de 96 %.

Suivez le lien du polymorphisme sélectionné pour lire une brève description de la façon dont le polymorphisme sélectionné affecte VIH et voir une liste des études existantes.

Polymorphismes SNP liés au sujet VIH: