vih genético
Por Li Dali, Ph.D.
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El VIH, un virus que causa inmunodeficiencia en humanos, pertenece al género Lentivirus de la subfamilia Orthoretrovirinae de la familia Retroviridae [1]. El VIH se clasifica en dos tipos, VIH-1 y VIH-2, según los rasgos genéticos y las variaciones en los antígenos virales. El género Lentivirus también incluye virus de inmunodeficiencia de primates no humanos, como el virus de inmunodeficiencia de simios (VIS).
Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr y Vpu (o Vpx para VIH-2) son genes que regulan las proteínas responsables de controlar la capacidad del VIH para infectar células, replicarse e inducir enfermedades.
Variaciones en los genes que afectan la susceptibilidad a la infección por VIH:
La entrada del VIH-1 en las células se ve facilitada por CCR5, un correceptor primario. Las variaciones en el gen codificante y el promotor de CCR5 pueden alterar la expresión del receptor en la superficie celular, lo que afecta la progresión de la infección. CCR5, también conocido como CD195, es un receptor de quimiocina β ubicado en el cromosoma 3, rama p en la posición 21. El gen tiene múltiples variaciones alélicas, incluida la mutación delta32 (rs333), que da como resultado un receptor no funcional debido a una Eliminación de 32 pb. El VIH-1 requiere unirse a los receptores CCR5 y CXCR4 de los linfocitos CD4 a través de la glicoproteína viral gp120 para ingresar a las células. Sin embargo, la mutación delta32 impide que el VIH-1 entre en las células T, lo que hace que los individuos sean homocigotos para la mutación (delta32-delta32) resistentes a la infección por VIH-1. CCR5-delta32 está presente en entre el 5% y el 14% de las poblaciones europeas, pero es raro en las poblaciones asiáticas y africanas.
CD192, también conocido como CCR2, es un receptor de quimiocina producido por el gen CCR2. Este gen codifica dos isoformas del receptor CCL2 del quimioatrayente de monocitos-1, que es responsable de la quimiotaxis de monocitos. CD192 juega un papel crucial en la migración de monocitos durante enfermedades inflamatorias como la artritis reumatoide y también es responsable de la respuesta inflamatoria a los tumores. Además, los receptores producidos por este gen facilitan la movilización de calcio dependiente de agonistas e inhiben la adenilato ciclasa.
El gen CX3CR1 produce una proteína con el mismo nombre, también conocida como receptor de fractalquina o receptor de proteína G 13 (GPR13). Esta proteína se une a la quimiocina CX3CL1, que incluye fractalquina y neurotactina, y afecta la adhesión y migración de los leucocitos. Además, CX3CR1 actúa como correceptor del VIH-1 y facilita la entrada del virus a las células. Las alteraciones de este gen pueden aumentar la susceptibilidad a la infección por VIH-1 y acelerar la progresión hacia el SIDA.
El gen HLA-C tiene una región 5' llamada Rs9264942, ubicada a 35 kb del inicio de la transcripción. Esta región tiene diferentes variantes genéticas (T/T, C/T y C/C). Entre los ciudadanos europeos, aproximadamente el 10% tiene la variante C/C, que está relacionada con una disminución significativa de la carga viral del VIH en comparación con los homocigotos T/T. Los antígenos HLA-C son cruciales para controlar la infección por VIH al actuar como ligandos para KIR en las células NK y presentar antígenos a los linfocitos T citotóxicos. El nivel de activación de los linfocitos NK está influenciado por la expresión de HLA-C.
HLA-B*57 es un tipo de antígeno B17 que se usa comúnmente en el cuidado de pacientes VIH positivos. Su designación es particularmente importante para determinar la probabilidad de una reacción de hipersensibilidad a abacavir. Antes del uso rutinario de la prueba HLA-B*5701 en pacientes con VIH, alrededor del 8% de los que tomaban abacavir experimentaban reacciones de hipersensibilidad, que podrían conducir a reacciones anafilácticas potencialmente mortales al volver a administrar el fármaco. Sin embargo, la identificación de HLA-B*57 ha ayudado a reducir significativamente este riesgo, con un valor de predicción positivo del 61,2%, un valor de predicción negativo del 95,5%, una sensibilidad del 44% y una especificidad del 96%.
Siga el enlace del polimorfismo seleccionado para leer una breve descripción de cómo el polimorfismo seleccionado afecta a VIH y ver una lista de estudios existentes.
Polimorfismos SNP relacionados con el tema VIH:
| rs1799864 | Riesgo un 58% mayor de desarrollar SIDA en los 4 primeros años tras un resultado positivo en la prueba del VIH. |
| rs2572886 | Riesgo 1,4 veces mayor de infección por VIH. |
| rs8321 | El polimorfismo de nucleótido único HLA-C se asocia a un aumento de la carga viral en personas infectadas por el VIH-1. |
| rs2395029 | El polimorfismo de nucleótido único HCP5 se asocia a una progresión lenta del SIDA en mujeres infectadas por el VIH-1. |
| rs2234358 | El gen CXCR6 es un nuevo receptor de quimioquinas implicado en la prevención a largo plazo de la progresión del SIDA. |
| rs17762192 | El locus 1q41 asociado a la tasa de progresión de la enfermedad por VIH-1 a SIDA clínico. |
| rs9368699 | Un polimorfismo de nucleótido único que contribuye a la ralentización natural a largo plazo de la progresión de la infección por VIH. |
| rs10484554 | |
| rs3108919 | |
| rs1020064 | |
| rs1522232 | |
| rs4118325 | |
| rs10800098 | |
| rs1360517 | |
| rs1556032 | |
| rs1015164 | |
| rs11239930 | |
| rs6467710 | |
| rs11884476 | |
| rs7217319 | |
| rs6441975 | |
| rs477687 | |
| rs572880838 | |
| rs6076463 | |
| rs9264942 | |
| rs4418214 | |
| rs3131018 | |
| rs9261174 | |
| rs8069770 | |
| rs12483205 | |
| rs152363 | |
| rs1265112 | |
| rs1127888 | |
| rs667859 | |
| rs2306242 | |
| rs444772 | |
| rs3796375 | |
Acerca del autor
Li Dali
Li Dali, beneficiario del Fondo Nacional para Jóvenes Sobresalientes, es investigador en la Escuela de Ciencias de la Vida de la Universidad Normal del Este de China. Obtuvo su doctorado en genética de la Universidad Normal de Hunan en 2007 y realizó investigaciones colaborativas en la Universidad de Texas A&M durante sus estudios doctorales. Li Dali y su equipo han optimizado e innovado la tecnología de edición génica, lo que ha llevado al establecimiento de un sistema de clase mundial para la construcción de modelos de enfermedades mediante edición génica. El ictus isquémico tiene una etiología multifactorial, en la que las causas genéticas desempeñan un... El TDAH, un trastorno del comportamiento que suele comenzar durante la infancia, se caracteriza por... Si las convulsiones son causadas por un defecto genético conocido o presunto o un problema...
