Генетический ВИЧ

Если вы прошли тест ДНК такой как 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage или другой компании, занимающейся тестированием, вы можете узнать больше о личных факторах риска основных заболеваний. Нажав кнопку выше ⬆️, вы можете загрузить файл данных ДНК и получить наиболее полный персонализированный 250-страничный отчет о состоянии здоровья со ссылками на исследования.

ВИЧ, вирус, вызывающий иммунодефицит у человека, принадлежит к роду Lentivirus подсемейства Orthoretrovirinae семейства Retroviridae [1]. ВИЧ классифицируется на два типа: ВИЧ-1 и ВИЧ-2, в зависимости от генетических особенностей и вариаций вирусных антигенов. Род Lentivirus также включает вирусы иммунодефицита приматов, не относящиеся к человеку, такие как вирус иммунодефицита обезьян (SIV).

Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr и Vpu (или Vpx для ВИЧ-2) — это гены, которые регулируют белки, ответственные за контроль способности ВИЧ инфицировать клетки, размножаться и вызывать заболевания.

Вариации генов, которые влияют на восприимчивость к ВИЧ-инфекции:

Входу ВИЧ-1 в клетки способствует CCR5, первичный корецептор. Вариации кодирующего гена и промотора CCR5 могут изменять экспрессию рецепторов на поверхности клеток, влияя на прогрессирование инфекции. CCR5, также известный как CD195, представляет собой рецептор β-хемокина, расположенный на хромосоме 3, p-ветвь в положении 21. Ген имеет множество аллельных вариаций, включая мутацию delta32 (rs333), которая приводит к нефункциональному рецептору из-за Делеция 32 п.н. Для проникновения в клетки ВИЧ-1 требует связывания как с рецепторами CCR5, так и с CXCR4 на лимфоцитах CD4 через вирусный гликопротеин gp120. Однако мутация delta32 предотвращает проникновение ВИЧ-1 в Т-клетки, делая людей, гомозиготных по мутации (delta32-delta32), устойчивыми к инфекции ВИЧ-1. CCR5-delta32 присутствует у 5–14% населения Европы, но редко встречается у населения Азии и Африки.

CD192, также известный как CCR2, представляет собой хемокиновый рецептор, который продуцируется геном CCR2. Этот ген кодирует две изоформы рецептора хемоаттрактанта-1 моноцитов CCL2, который отвечает за хемотаксис моноцитов. CD192 играет решающую роль в миграции моноцитов при воспалительных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит, а также отвечает за воспалительную реакцию на опухоли. Кроме того, рецепторы, продуцируемые этим геном, облегчают агонист-зависимую мобилизацию кальция и ингибируют аденилатциклазу.

Ген CX3CR1 продуцирует белок с таким же названием, также называемый рецептором фракталкина или рецептором G-белка 13 (GPR13). Этот белок связывается с хемокином CX3CL1, в состав которого входят фракталкин и нейротактин, и влияет на адгезию и миграцию лейкоцитов. Кроме того, CX3CR1 действует как корецептор ВИЧ-1 и облегчает проникновение вируса в клетки. Изменения в этом гене могут повысить восприимчивость к инфекции ВИЧ-1 и ускорить прогрессирование СПИДа.

Ген HLA-C имеет 5'-участок под названием Rs9264942, расположенный в 35 т.п.н. от начала транскрипции. Этот регион имеет разные генетические варианты (T/T, C/T и C/C). Среди граждан Европы примерно 10% имеют вариант C/C, что связано со значительным снижением вирусной нагрузки ВИЧ по сравнению с гомозиготами T/T. Антигены HLA-C играют решающую роль в контроле ВИЧ-инфекции, поскольку они служат лигандами для KIR на NK-клетках и представляют антигены цитотоксическим Т-лимфоцитам. На уровень активации NK-лимфоцитов влияет экспрессия HLA-C.

HLA-B*57 — это тип антигена B17, который обычно используется при лечении ВИЧ-положительных пациентов. Его назначение особенно важно для определения вероятности реакции гиперчувствительности к абакавиру. До рутинного использования тестирования HLA-B*5701 у пациентов с ВИЧ около 8% из тех, кто принимал абакавир, испытывали реакции гиперчувствительности, которые потенциально могли привести к опасным для жизни анафилактическим реакциям при повторном назначении препарата. Однако идентификация HLA-B*57 помогла значительно снизить этот риск: положительная прогностическая ценность составила 61,2%, отрицательная прогностическая ценность - 95,5%, чувствительность - 44% и специфичность - 96%.

Пройдите по ссылке выбранного полиморфизма, чтобы прочитать краткое описание как выбранный полиморфизм влияет на ВИЧ и ознакомьтесь со списком существующих исследований.

Полиморфизмы SNP, связанные с темой ВИЧ: