Загрузите DNA data файл теста

23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage

и получите расширенный
персонализированный отчет
бесплатно без регистрации

Принимаются файлы .txt, .csv, .zip, .csv.gz

Данные файлов не хранятся на сервере

Генетический ВИЧ

Если вы прошли тест ДНК такой как 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage или другой компании, занимающейся тестированием, вы можете узнать больше о личных факторах риска основных заболеваний. Нажав кнопку выше ⬆️, вы можете загрузить файл данных ДНК и получить наиболее полный персонализированный 250-страничный отчет о состоянии здоровья со ссылками на исследования.

ВИЧ, вирус, вызывающий иммунодефицит у человека, принадлежит к роду Lentivirus подсемейства Orthoretrovirinae семейства Retroviridae [1]. ВИЧ классифицируется на два типа: ВИЧ-1 и ВИЧ-2, в зависимости от генетических особенностей и вариаций вирусных антигенов. Род Lentivirus также включает вирусы иммунодефицита приматов, не относящиеся к человеку, такие как вирус иммунодефицита обезьян (SIV).

Tat, Rev, Nef, Vif, Vpr и Vpu (или Vpx для ВИЧ-2) — это гены, которые регулируют белки, ответственные за контроль способности ВИЧ инфицировать клетки, размножаться и вызывать заболевания.

Вариации генов, которые влияют на восприимчивость к ВИЧ-инфекции:

Входу ВИЧ-1 в клетки способствует CCR5, первичный корецептор. Вариации кодирующего гена и промотора CCR5 могут изменять экспрессию рецепторов на поверхности клеток, влияя на прогрессирование инфекции. CCR5, также известный как CD195, представляет собой рецептор β-хемокина, расположенный на хромосоме 3, p-ветвь в положении 21. Ген имеет множество аллельных вариаций, включая мутацию delta32 (rs333), которая приводит к нефункциональному рецептору из-за Делеция 32 п.н. Для проникновения в клетки ВИЧ-1 требует связывания как с рецепторами CCR5, так и с CXCR4 на лимфоцитах CD4 через вирусный гликопротеин gp120. Однако мутация delta32 предотвращает проникновение ВИЧ-1 в Т-клетки, делая людей, гомозиготных по мутации (delta32-delta32), устойчивыми к инфекции ВИЧ-1. CCR5-delta32 присутствует у 5–14% населения Европы, но редко встречается у населения Азии и Африки.

CD192, также известный как CCR2, представляет собой хемокиновый рецептор, который продуцируется геном CCR2. Этот ген кодирует две изоформы рецептора хемоаттрактанта-1 моноцитов CCL2, который отвечает за хемотаксис моноцитов. CD192 играет решающую роль в миграции моноцитов при воспалительных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит, а также отвечает за воспалительную реакцию на опухоли. Кроме того, рецепторы, продуцируемые этим геном, облегчают агонист-зависимую мобилизацию кальция и ингибируют аденилатциклазу.

Ген CX3CR1 продуцирует белок с таким же названием, также называемый рецептором фракталкина или рецептором G-белка 13 (GPR13). Этот белок связывается с хемокином CX3CL1, в состав которого входят фракталкин и нейротактин, и влияет на адгезию и миграцию лейкоцитов. Кроме того, CX3CR1 действует как корецептор ВИЧ-1 и облегчает проникновение вируса в клетки. Изменения в этом гене могут повысить восприимчивость к инфекции ВИЧ-1 и ускорить прогрессирование СПИДа.

Ген HLA-C имеет 5'-участок под названием Rs9264942, расположенный в 35 т.п.н. от начала транскрипции. Этот регион имеет разные генетические варианты (T/T, C/T и C/C). Среди граждан Европы примерно 10% имеют вариант C/C, что связано со значительным снижением вирусной нагрузки ВИЧ по сравнению с гомозиготами T/T. Антигены HLA-C играют решающую роль в контроле ВИЧ-инфекции, поскольку они служат лигандами для KIR на NK-клетках и представляют антигены цитотоксическим Т-лимфоцитам. На уровень активации NK-лимфоцитов влияет экспрессия HLA-C.

HLA-B*57 — это тип антигена B17, который обычно используется при лечении ВИЧ-положительных пациентов. Его назначение особенно важно для определения вероятности реакции гиперчувствительности к абакавиру. До рутинного использования тестирования HLA-B*5701 у пациентов с ВИЧ около 8% из тех, кто принимал абакавир, испытывали реакции гиперчувствительности, которые потенциально могли привести к опасным для жизни анафилактическим реакциям при повторном назначении препарата. Однако идентификация HLA-B*57 помогла значительно снизить этот риск: положительная прогностическая ценность составила 61,2%, отрицательная прогностическая ценность - 95,5%, чувствительность - 44% и специфичность - 96%.

Пройдите по ссылке выбранного полиморфизма, чтобы прочитать краткое описание как выбранный полиморфизм влияет на ВИЧ и ознакомьтесь со списком существующих исследований.

Полиморфизмы SNP, связанные с темой ВИЧ:

rs1799864На 58% больше риск развития СПИДа в течение первых 4 лет после положительного результата теста на ВИЧ.
rs2572886В 1.4 раза повышен риск заражения ВИЧ.
rs8321Однонуклеотидный полиморфизм HLA-C связан с повышенным уровнем вирусной нагрузки у лиц, инфицированных ВИЧ-1.
rs2395029Однонуклеотидный полиморфизм HCP5 связан с медленным прогрессированием СПИДа у женщин, инфицированных ВИЧ-1.
rs2234358Ген CXCR6 как новый хемокиновый рецептор, участвующий в долгосрочном предотвращении прогрессирования СПИДа.
rs17762192Локус 1q41, связанный со скоростью прогрессирования заболевания ВИЧ-1 до клинического СПИДа.
rs9368699Однонуклеотидный полиморфизм, который способствует естественному долговременному замедлению прогрессирования ВИЧ-инфекции.
rs10484554
rs3108919
rs1020064
rs1522232
rs4118325
rs10800098
rs1360517
rs1556032
rs1015164
rs11239930
rs6467710
rs11884476
rs7217319
rs6441975
rs477687
rs572880838
rs6076463
rs9264942
rs4418214
rs3131018
rs9261174
rs8069770
rs12483205
rs152363
rs1265112
rs1127888
rs667859
rs2306242
rs444772
rs3796375
en
|
de
|
fr
|
es
|
it
|
ua
|
ru

Поддержка