Ядерні гормональні рецептори
Від Li Dali, Ph.D.
Якщо ви пройшли тест ДНК такий як 23andMe, AncestryDNA, FamilyTreeDNA, MyHeritage або іншій компанії, що займається тестуванням, ви можете дізнатися більше про особисті фактори ризику основних захворювань. Натиснувши кнопку вище ⬆️, ви можете завантажити файл даних ДНК і отримати найповніший персоналізований 250-сторінковий звіт про стан здоров'я з посиланнями на дослідження.
Активовані ліганд-регульовані фактори транскрипції, спільно відомі як ядерні рецептори, реагують на різні жиророзчинні сигнали, такі як естроген, прогестерон, ретиноєва кислота, оксистероли та тиреоїдний гормон.
HRE, короткі послідовності ДНК, які зазвичай розташовані вище за сайт ініціації транскрипції, зв’язуються рецепторами ядерних гормонів, щоб регулювати транскрипцію генів. Ці класичні підсилювачі або глушники можуть впливати на синтез мРНК незалежно від їх положення та орієнтації в промоторній області гена.
Націлювання рецепторів на їхні елементи гормональної відповіді (HRE) відповідає центральному домену зв’язування ДНК (DBD). DBD, який втілює мотив цинкового пальця типу II, містить два субдомени, кожен з яких містить чотири залишки цистеїну, що координують іон цинку та альфа-спіраль. Діючи як димери, окремі мономери з DBD розпізнають шість послідовностей пар основ на ДНК через напівсайти, де її спіраль зчитування вступає в специфічні контакти з великими борознами. Цей механізм дозволяє розрізняти різні орієнтації послідовності в межах вищезгаданого елемента відповіді, беручи до уваги інтервал і орієнтацію. Досить цікаво, що ці білки все ще зберігають гнучкість у розпізнаванні різних послідовностей ДНК, навіть якщо амінокислотні заміни присутні у відповідних спіралях зчитування рецепторів, не порушуючи повного зв’язування.
Можна встановити кореляцію між гнучкістю в розпізнаванні послідовності ДНК і специфічними базовими контактами, що спостерігаються в кристалічних структурах. Провівши дослідження молекулярної динаміки зв’язування ДНК рецепторів естрогену з певними та неспецифічними послідовностями, ми змогли знайти рішення для цього запиту. Для детального розуміння нашого дослідження перейдіть за наданим посиланням.