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Les facteurs de transcription activés régulés par un ligand, collectivement appelés récepteurs nucléaires, répondent à divers signaux liposolubles tels que les œstrogènes, la progestérone, l'acide rétinoïque, les oxystérols et les hormones thyroïdiennes.
Les HRE, courtes séquences d'ADN généralement situées en amont du site d'initiation de la transcription, sont liées par des récepteurs hormonaux nucléaires afin de réguler la transcription des gènes. Ces éléments classiques activateurs ou silencieux peuvent influencer la synthèse de l'ARNm quelles que soient leur position et leur orientation dans la région promotrice d'un gène.
Le ciblage des récepteurs vers leurs éléments de réponse hormonale (HRE) est sous la responsabilité du domaine central de liaison à l'ADN (DBD). Le DBD, qui incarne un motif en doigt de zinc de type II, contient deux sous-domaines comprenant chacun quatre résidus cystéine coordonnant un ion zinc et une hélice alpha. Fonctionnant comme des dimères, les monomères individuels du DBD reconnaissent six séquences de paires de bases sur l'ADN via des demi-sites où son hélice de lecture entre en contact spécifique avec les sillons majeurs. Ce mécanisme permet la discrimination entre diverses orientations de séquence au sein de l'élément de réponse susmentionné en prenant note de l'espacement et de l'orientation. Il est intéressant de noter que ces protéines conservent leur flexibilité dans la reconnaissance de différentes séquences d'ADN, même lorsque des substitutions d'acides aminés sont présentes dans les hélices de lecture de leurs récepteurs respectifs, sans perturber complètement la liaison.
La corrélation entre la flexibilité de la reconnaissance des séquences d'ADN et les contacts de bases spécifiques observés dans les structures cristallines peut être établie. En menant des études de dynamique moléculaire sur la liaison à l'ADN des récepteurs d'œstrogènes avec des séquences particulières et non spécifiques, nous avons pu trouver une solution à cette question. Pour une compréhension détaillée de notre étude de recherche, veuillez vous référer au lien fourni.